เปิดตัว “ธนาคารเชื้อโรค” ในสัตว์ฟันแทะแห่งมณฑลเฮยหลงเจียง: ตรวจพบเชื้อโรคสำคัญ ได้แก่ ไวรัสลาสซาและไวรัสฮันตา

การศึกษาเมตาจีโนมิกส์ล่าสุดได้เปิดเผยให้เห็นถึงความหลากหลายของไวรัสและแบคทีเรียที่พบในหนูในมณฑลเฮยหลงเจียง ซึ่งรวมถึงไวรัสลาสซา ไวรัสอะมูร์ เชื้อซัลโมเนลลา และเชื้อเยอร์ซิเนียเพสติส

การวิจัยนี้ใช้ชุดเพิ่มความเข้มข้นของ RNA จากเชื้อก่อโรค จาก Macro & Micro-Testโดยอาศัยเทคโนโลยีการจับโพรบ วิธีการนี้ช่วยรักษา RNA ของจุลินทรีย์ไว้ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ด้วยการกำจัด rRNA ของโฮสต์และชิ้นส่วนโฮสต์ที่อนุรักษ์ไว้อื่นๆ ออกไปอย่างเลือกสรร ทำให้ความไวในการตรวจจับเชื้อโรคดีขึ้นอย่างมาก ขั้นตอนนี้ในการเพิ่มความเข้มข้นของ RNA ของเชื้อโรคมีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการบรรลุอัตราการตรวจจับที่สูง และให้การสนับสนุนทางเทคนิคที่แข็งแกร่งสำหรับการเฝ้าระวังเชื้อโรค

สัตว์ฟันแทะ: แหล่งสะสมที่สำคัญของโรคติดต่อจากสัตว์สู่คน

สัตว์จำพวกหนูเป็นกลุ่มสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่มีจำนวนชนิดมากที่สุดและกระจายตัวอย่างกว้างขวางที่สุด โดยมีมากกว่า 2,000 ชนิดทั่วโลก และคิดเป็นสัดส่วนมากกว่า 40% ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมทั้งหมด

นอกเหนือจากความสำคัญทางนิเวศวิทยาแล้ว สัตว์ฟันแทะยังเป็นแหล่งสะสมและพาหะสำคัญของเชื้อโรคที่ติดต่อจากสัตว์สู่คนจำนวนมากอีกด้วยเนื่องจากแหล่งที่อยู่อาศัยของสัตว์ฟันแทะมักทับซ้อนกับสภาพแวดล้อมของมนุษย์—ไม่ว่าจะผ่านการกัดโดยตรง การสัมผัสกับมูลสัตว์ หรือการแพร่เชื้อทางอ้อมผ่านหมัดและไร—เชื้อโรคที่พวกมันเป็นพาหะจึงก่อให้เกิดภัยคุกคามต่อสุขภาพของประชาชนอย่างต่อเนื่อง

ที่น่าสังเกตคือ โรคติดเชื้ออุบัติใหม่กว่า 70% มีต้นกำเนิดมาจากสัตว์ป่า โดยสัตว์ฟันแทะเป็นแหล่งสะสมเชื้อไวรัสที่สำคัญที่สุดแหล่งหนึ่ง

เขตชายแดนเฮยหลงเจียง: แนวหน้าสำหรับการเฝ้าระวังเชื้อโรค

มณฑลเฮยหลงเจียง ซึ่งเป็นมณฑลชายแดนทางตะวันออกเฉียงเหนือของจีน มีทรัพยากรทางนิเวศวิทยาที่อุดมสมบูรณ์และมีพรมแดนติดกับหลายประเทศ การผสมผสานระหว่างความหลากหลายทางชีวภาพที่อุดมสมบูรณ์และการเคลื่อนย้ายประชากรข้ามพรมแดนบ่อยครั้ง ทำให้เกิดสภาวะที่เอื้อต่อการแพร่กระจายของเชื้อโรค

ระหว่างเดือนมิถุนายนถึงกรกฎาคม 2564 นักวิจัยได้เก็บตัวอย่างหนูป่าจำนวน 67 ตัวจากเมืองเหิงเตาเหอจือ เมืองมู่ตานเจียง ตัวอย่างที่เก็บได้ประกอบด้วย:

ล 20อะโพเดมัส เพนินซูลา

ล 47ไมโอเดส รูโฟคานัส

ตัวอย่างทั้งหมดถูกจับได้ในพื้นที่อยู่อาศัยและพื้นที่เกษตรกรรมโดยรอบ ซึ่งแสดงให้เห็นถึงความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดระหว่างชุมชนมนุษย์และแหล่งที่อยู่อาศัยของสัตว์ป่า

เทคโนโลยีการเพิ่มจำนวนเชื้อก่อโรค: การเอาชนะการรบกวนจากสภาพแวดล้อมของโฮสต์

ในการจัดลำดับจีโนมแบบเมตาจีโนมิกส์ โดยทั่วไปแล้ว RNA ของโฮสต์จะครอบงำลำดับการอ่าน ทำให้สัญญาณของเชื้อโรคที่มีปริมาณน้อยถูกบดบัง

เพื่อแก้ไขความท้าทายนี้ การศึกษาจึงได้ใช้ชุดตรวจหาเมตาจีโนมิกส์ของเชื้อโรคจาก Macro & Micro-Test การใช้เทคโนโลยีการจับโพรบ โดยใช้โพรบที่ออกแบบมาโดยเฉพาะเพื่อจับกับ rRNA ของโฮสต์และลำดับที่อนุรักษ์ไว้ ทำให้สามารถกำจัดพวกมันออกไปและเพิ่มปริมาณ RNA ของจุลินทรีย์ได้

วิธีการนี้ช่วยเพิ่มความไวในการตรวจจับเชื้อโรคได้อย่างมาก ทำให้การลำดับดีเอ็นเอในขั้นตอนถัดไปสามารถตรวจพบเชื้อโรคได้ในสัดส่วนที่สูงขึ้น ขั้นตอนการเพิ่มความเข้มข้นนี้ได้วางรากฐานที่มั่นคงสำหรับการระบุลักษณะเฉพาะของเชื้อโรคที่พบในสัตว์ฟันแทะได้อย่างแม่นยำ

หลังจากเพิ่มความเข้มข้นแล้ว ตัวอย่าง RNA จะถูกนำไปผ่านกระบวนการถอดรหัสย้อนกลับ การสร้างไลบรารี และการจัดลำดับจีโนมความเร็วสูง การวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศประกอบด้วย:

การกรองจีโนมของโฮสต์

l การจำแนกทางอนุกรมวิธานโดยใช้ Kraken2

l การแก้ไขความอุดมสมบูรณ์ด้วย Bracken

กระบวนการทำงานนี้สร้างโปรไฟล์ที่ครอบคลุมของชุมชนไวรัสและแบคทีเรีย

ผลการวิจัย: การแพร่ระบาดร่วมกันของไวรัสและแบคทีเรียหลายชนิด

ผลการค้นพบไวรัส

ไวรัสที่ตรวจพบนั้นอยู่ใน 21 วงศ์ไวรัส ซึ่งรวมถึง...อารีนาไวริเดและฮันตาไวริเด.

ผ่านเดอ โนโวจากการประกอบลำดับดีเอ็นเอโดยใช้ Megahit ได้สร้างคอนติ๊กของไวรัสจำนวน 154 ชิ้น ซึ่งในจำนวนนี้ 110 ชิ้นตรงกับไวรัส 19 ชนิดจากแปดวงศ์

In อะโพเดมัส เพนินซูลาโดยตรวจพบไวรัสต่อไปนี้:

l Arenaviruses: ไวรัส Lassa, ไวรัส Wenzhou, ไวรัส Gairo

l Hantaviruses: ไวรัสอามูร์, ไวรัสปูมาลา

In ไมโอเดส รูโฟคานัสตรวจพบไวรัส Rat arterivirus และไวรัส Amur

ในบรรดาเชื้อโรคเหล่านี้:

ไวรัสลาสซาเป็นสาเหตุของไข้เลือดออกไวรัส โดยมีอัตราการเสียชีวิตประมาณ 20%

ไวรัสอามูร์เป็นหนึ่งในเชื้อก่อโรคที่ทำให้เกิดไข้เลือดออกชนิดที่มีภาวะไตวาย (HFRS) ประเทศจีนมีรายงานผู้ติดเชื้อไวรัสฮันตาไวรัสมากที่สุดในโลก

ผลการตรวจพบแบคทีเรีย

มีการระบุสกุลแบคทีเรียทั้งหมด 1,051 สกุล

สกุลที่มีจำนวนมากที่สุด ได้แก่:

ลซัลโมเนลลา(26–31%)

ลเยอร์ซิเนีย(11–23%)

ซัลโมเนลลาเป็นเชื้อก่อโรคที่สำคัญที่ติดต่อทางอาหาร ซึ่งเป็นสาเหตุของไข้ไทฟอยด์ประมาณ 9 ล้านราย และเสียชีวิตประมาณ 110,000 รายต่อปีทั่วโลก

เยอร์ซิเนีย เพสติสเชื้อที่เป็นสาเหตุของโรคระบาดร้ายแรง ได้ก่อให้เกิดการระบาดใหญ่ครั้งประวัติศาสตร์ถึงสามครั้ง มณฑลเฮยหลงเจียงได้รับการยอมรับว่าเป็นหนึ่งในแหล่งแพร่ระบาดตามธรรมชาติของโรคระบาดในประเทศจีน และยังคงเป็นพื้นที่สำคัญลำดับต้นๆ สำหรับการเฝ้าระวังโรคระบาด

ความสำคัญของการศึกษา

ผลงานทางวิทยาศาสตร์

การศึกษาครั้งนี้เป็นการรายงานครั้งแรกเกี่ยวกับการพบชิ้นส่วนของไวรัส Lassa และไวรัส Rat Arteritis ในสัตว์ฟันแทะจากมณฑลเฮยหลงเจียง ซึ่งเป็นการขยายฐานข้อมูลเชื้อโรคที่แพร่กระจายโดยสัตว์ฟันแทะของจีน

เป็นการศึกษาลักษณะเฉพาะของชุมชนไวรัสและแบคทีเรียในประชากรหนูในท้องถิ่นอย่างเป็นระบบ ซึ่งเป็นข้อมูลพื้นฐานสำหรับการเฝ้าระวังโรคติดต่อจากสัตว์สู่คนในพื้นที่ชายแดน

ผลกระทบต่อสุขภาพของประชาชน

ผลการศึกษาเน้นย้ำถึงความจำเป็นในการเฝ้าระวังอย่างต่อเนื่องและการตรวจคัดกรองเชื้อโรคคาบสมุทรเอและม. รูโฟคานัส.

ข้อมูลเหล่านี้เป็นหลักฐานทางวิทยาศาสตร์ที่สนับสนุนกลยุทธ์การควบคุมแหล่งที่มาของโรคต่างๆ เช่น โรคระบาดและไข้เลือดออกที่มีภาวะแทรกซ้อนทางไต

จุดแข็งด้านระเบียบวิธีวิจัย

การจัดลำดับจีโนมแบบเมตาจีโนมิกส์ช่วยให้สามารถตรวจจับเชื้อโรคทั้งที่รู้จักและเชื้อโรคชนิดใหม่ได้อย่างเป็นกลาง

ในการศึกษาครั้งนี้ เทคโนโลยีการเพิ่มความเข้มข้นของเชื้อก่อโรคของ Macro & Micro-Test แสดงให้เห็นถึงประสิทธิภาพที่แข็งแกร่ง โดยสามารถเพิ่มประสิทธิภาพการตรวจจับเชื้อก่อโรคเป้าหมายในตัวอย่างทางชีวภาพที่ซับซ้อนได้อย่างมีประสิทธิผล ผลลัพธ์ยืนยันถึงความสามารถในการสนับสนุนการระบุเชื้อก่อโรคที่มีความไวสูงในการเฝ้าระวังสัตว์ป่า

คำแนะนำผลิตภัณฑ์

จากผลการใช้งานที่ประสบความสำเร็จในงานวิจัยนี้ ชุดตรวจวิเคราะห์ RNA ของเชื้อก่อโรค Macro & Micro-Test จึงเป็นชุดตรวจที่แนะนำอย่างยิ่งสำหรับการวิจัยด้านการเฝ้าระวังทางเมตาจีโนมิกส์

ด้วยการกำจัดกรดนิวคลีอิกของโฮสต์อย่างมีประสิทธิภาพและเพิ่มปริมาณลำดับนิวคลีอิกของจุลินทรีย์ ชุดตรวจนี้จึงช่วยเพิ่มความไวในการตรวจจับและคุณภาพของข้อมูลได้อย่างมาก นับเป็นเครื่องมือสำคัญสำหรับการตรวจหาเชื้อก่อโรคในตัวอย่างที่ซับซ้อนได้อย่างแม่นยำ และให้การสนับสนุนทางเทคนิคที่แข็งแกร่งสำหรับการเฝ้าระวังด้านสาธารณสุข การประเมินความเสี่ยงจากโรคติดต่อจากสัตว์สู่คน และการเตรียมความพร้อมรับมือกับการระบาด

Contact to learn more: marketing@mmtest.com